安捷倫(lun) Cary 60 紫外-可見分光光度計配 置微光纖 探頭測定 4 °C 下微量 DNA 的 純度
應用摘要 醫藥/生物技術 |
總結 |
安捷倫(lun) Cary 60 紫外-可見分光光度計是在儲(chu) 存環境(如冰箱)下直接測定微量生 |
物樣品的理想儀(yi) 器。本應用報告展示了如何使用 Cary 60 及其微光纖探頭附件測 定 4 °C 下 的 DNA 純度——結果表明,使用該儀(yi) 器能夠大幅節省時間和成本,同 時數據精確度和重現性毫無損 失。 |
• 不再需要比色皿 |
• 直接測定 4 °C 冰箱中的樣品 • 節省每次分析的時間與(yu) 成本 前言 多年以來,紫外-可見分光光度計一直是生物技術領域中測定 DNA 純度和濃度的 一項重要工具。該 方法最早由 Warburg 和 Christian 在 1942 年開發 1,隨後由 Sambrook 等人在 1989 年進行了 優(you) 化,使其可用於(yu) 實驗室中簡便、快速的測定 2。 分光光度法的主要優(you) 點在於(yu) 測定過程: 1) 簡便; 2) 準確; 3) 不破壞樣品。這一 方法可以節省時間而不損失數據質量,並且在測定過程中無需使用大 體(ti) 積的樣 品或額外的耗材,從(cong) 而帶來經濟效益。 |
在之前的文章中,我們(men) 介紹了安捷倫(lun) Cary 50 紫外-可見分 光光度計配置 Hellma(德國 Hellma GmbH & Co.)的 Traycell 微量比色
池紫外-可見在室溫下準確、可重現地測 定微量 DNA 的方法 3。在本研究中,我們(men) 采用帶光纖探頭的 Cary 60 紫外-可見分光光度計進
行了方法擴展研究,在 4 。C 以及普通實驗室環境光照條件下測定了小體(ti) 積樣品。本方 法使得用戶可以將儀(yi) 器靠近樣品,而不是像傳(chuan)
統光譜方法 那樣將樣品放入儀(yi) 器中,從(cong) 而能夠在很短的時間內(nei) 完成分 析。Cary 60 的光學設計使這一優(you) 勢得以實現,它主要憑 借
其的高強度閃爍氙燈以及最新型的電子器件,使係 統能夠有效地監控吸光度的微小變化而不受環境背景光的 任何影響。本文深入
討論了這一方法的主要優(you) 點。
儀(yi) 器與(yu) 材料
部件號 | 說明 |
G6860AA
7910035600 G6866A 6610000800 D-4764(Sigma 化學公司) | Cary 60 紫外-可見分光光度計,配備 WinUV 軟件和 HP 電腦(台式機) 微光纖探頭 光纖探頭耦合器 石英比色皿(光程 1 cm;兩(liang) 隻裝) 小牛胸腺 DNA;1 |
方法與(yu) 結果
將小牛胸腺 DNA 用純淨水(MilliQ)稀釋得到不同濃度的樣 品,濃度範圍 0–50 µg/ml。
配有光纖耦合器以及微探頭的 Cary 60, 如圖 1 所示。在 Eppendorf 管中加入 150 µL 純淨水(MilliQ),將其讀數作為(wei) 空白。
由於(yu) 分子生物學試劑通常保存於(yu) 冷藏條件下,因此所有樣 品直接從(cong) 4 。C 冰箱中取出並進行分析。
圖 1. 配有光纖附件的 Cary 60 測試 4 。C 下 Eppendorf 管中 150 μL DNA 的示意 圖。
開始時,使用 WinUV 軟件“掃描"模塊在 340 到 240 nm 範 圍進行掃描以確認最大吸收峰以及所購買(mai) 的按 50:50 稀釋 的 DNA 樣品的可靠性(圖 2)。
波長(nm) |
圖 2. 對 4 。C 下兩(liang) 個(ge) 濃度的 150 µL DNA 樣品的掃描表明特征吸收峰出現在 260 nm 處。注意:50 µg/ml DNA 最大吸光度值 1.0Abs,25 µg/ml DNA 最大吸光度 值 0.5Abs,遵守 Beer Lambert 定律(A = εcl)。
為(wei) 了 確 認 DNA 的 純 度 ,使 用 WinUV 軟 件 專(zhuan) 門 的 “RNA/DNA"模塊測定 260/280 比率,該模塊可自動計算 DNA 樣品的純
度。如圖3 所示,這一模塊使用非常簡單,可 以在一分鍾內(nei) 完成分析。
圖 3. 簡便、專(zhuan) 用的 Cary WinUV 自動計算 DNA 的純度、可靠性和濃度
最後,繪製濃度曲線以評估同一實驗室條件下不同濃度 DNA 樣品讀數的線性和重現性(圖4)。在兩(liang) 個(ge) DNA 樣品讀 數間隙使
用 MilliQ 純淨水清洗微探頭。
討論
測定五個(ge) 樣品所用的時間不到兩(liang) 分鍾。傳(chuan) 統方法使用微量 比色皿,需要等待樣品加熱至室溫,而且在每兩(liang) 次測定間 需要清洗微量比色
皿。總之,使用 Cary 60 光纖係統可以顯 著降低大約 80% 的分析時間,同時采用光纖技術不易受到 樣品處理引起的潛在汙染。使用微
探頭可以獲得高精度的 數據並大大縮短測定低溫樣品所需的時間,這表明 Cary 60 是一種適於(yu) 測定生物樣品(如 DNA)的簡便、快速且
高性價(jia) 比的係統。本方法可以輕鬆地直接擴展到其它樣品類型, 例如可在 280 nm 處測定蛋白質。
結論
Cary 60 紫外-可見分光光度計是使用光纖采樣的理想儀(yi) 器, 它的高強度閃爍氙燈可以提供的靈敏度和重現性。 本應用報告所展示的測
定 DNA 樣品時的分析速度、結果重 現性以及易用性證明了該儀(yi) 器係統的強大優(you) 勢。
使用帶光纖的 Cary 60 分析生物樣品還具有如下優(you) 點:
• 可以直接測定高溫或低溫樣品(4 °C – 110 °C)而無需 考慮冷凝的問題,如果使用比色皿則由於(yu) 冷凝可能導 致結果不正確或重現性不好
• 樣品體(ti) 積不受限製,可以低至 40 µL,也可以無限大
• 無需購買(mai) 昂貴的石英微量比色皿,更節省了清洗比色 皿的時間
• 使用反射探頭還可以分析固體(ti) 、粉末或凝膠類樣品
圖 4. 使用微探頭光纖附件在實驗室常規光照條件下測定 4 °C 下 Eppendorf 管中 50 µL DNA 樣品(0–
50 µg/mL)得到的濃度曲線。校準方程:Abs = 0.02393*濃 度;相關(guan) 係數 = 0.99126。